DNAdvance 性能データ

組織サンプルからのゲノムDNAの抽出

DNAdvanceはSPRI磁性ビーズ技術により、組織サンプルから高品質なDNA抽出を実現するゲノムDNA抽出試薬キットです。DNAdvanceは他の試薬キットに比べて、高品質かつ高収量であることが特徴です。また、ベックマン・コールターの自動分注機Biomekシリーズを用いて、96ウェルプレートでの自動抽出も可能です。

  •  PCRなどの下流アプリケーションに対応
  • 他の試薬キットより3倍以上の収量
  • 手動実験と自動処理の両方に対応 

高品質・高収量のDNA抽出

DNAdvanceと他の試薬キットを用いて、肝臓組織 20mgからゲノムDNAを抽出しました。Thermo Fisher ScientificNanoDropを用いてDNAの定量および純度評価を行いました。DNAdvanceは、他の試薬キットよりも多くのgDNAを抽出しました。エラーバーは、3回の実験の標準偏差を示しています。

Genomics Genfind v2 DNA YieldGenomics Genfind v2 DNA Purity

Genomics DNAdvance from Tissue Types

高品質・分解の少ないゲノムDNA抽出

  DNAdvanceは高品質なゲノムDNAを抽出します。4種類の組織から抽出したゲノムDNAを、Agilent Genomic DNA Screen Tapeで品質を評価しました。DNAdvance で抽出したDNAのDIN値は、すべての組織で高い値でした(Figure 3)。マウステール(Figure 4)と腎臓(Figure 5)から抽出したDNAの泳動チャートを示します。

Genomics Genfind v2 DNA Yield Genomics Genfind v2 DNA Purity

PCRを阻害するような夾雑物の残留がない

Genomics DNAdvance Tissue Amplify DNA

  Figure 6:β(ベータ)アクチン遺伝子(ActB)のエクソン4と5にまたがるように設計されたプライマーセット(Forward 5’-ggacttcgagcaagatgg-3’; Reverse 5’-agcactgtgttggcgtacag-3’)を用いたqPCRによりDNAの増幅を確認したところ、327bpのアンプリコンが得られました。DNAdvanceにて4種類の組織から抽出したゲノムDNAはいずれも良好な増幅を示しており、PCR阻害物質を十分に除去精製できていることが分かりました。

様々な組織からのDNA抽出

5種類の組織から抽出したゲノムDNAの収量と純度を、Thermo Fisher Scientific NanoDropを用いて測定しました。表に示すとおり、下流アプリケーションでの使用に十分な結果が得られました。

Tissue Type gDNA Tield (µG) DNA Purity (A260/A280)
Liver 33.5 1.9
Brain 8.07 1.8
Kidney 16.1 1.8
Lung 7.28 1.8
Tail 5.38 1.8

DNAdvance ワークフロー 

Genomics DNAdvance Workflow

  1. LysisバッファーとProteinase Kで組織を溶解する。
  2. DNAを磁性ビーズに結合させる。
  3. 磁性ビーズと夾雑物を磁力で分離する。
  4. 磁性ビーズを70%エタノールで洗浄し、夾雑物を除去する。
  5. 洗浄を3回繰り返す。
  6. 磁性ビーズからDNAを溶出させる。
  7. DNAを新しいプレートに移す。

少ないピペッティング回数かつ短時間でDNA抽出

Genomics Genfind v2 DNA YieldGenomics Genfind v2 DNA Purity

自動実験と手動処理の比較

DNAdvanceでDNA抽出を行うために必要な、ハンズオン時間(実際に手を動かす作業時間)と合計時間を表に示します(単位はhour)。この時間には、オーバーナイトの組織溶解は含まれていません。手動実験だけではなく、自動分注機Biomekシリーズで自動抽出を行うことができます。1200µlヘッドを装着したBiomek i-Series Multichannelで自動抽出に要する時間を示しており、手動実験と自動処理の所要時間の違いがわかります(NR = 推奨しない処理)。

DNAdvance Manual Automated
Batch Size 8 Hands-on-Time 0.25 0.25
Total Time 0.50 0.87
24 Hands-on-Time 0.25 0.25
Total Time 0.50 0.87
96 Hands-on-Time NR 0.25
Total Time NR 0.87
480 Hands-on-Time NR 0.25
Total Time NR 2.25
960 Hands-on-Time NR 0.25
Total Time NR 4.25

 

製品モデル

DNAdvanceは、スループットに合わせて2種類の製品を用意しています。表の製品番号をクリックして、お見積もりをご依頼ください。詳細についてはDNAdvanceのページをご覧ください。

PART # NAME PREPS
A48705 DNAdvance 384
A48706 DNAdvance

9600

 

 

病気やその他の状態の診断に使用することは意図されておらず、検証もされていません。
研究用にのみ使用してください。診断のために使用することはできません。
すべての商標は、それぞれの所有者に帰属します。Beckman Coulter, the stylized logo, Agencourt, AMPure, Biomek, GenFind, and SPRIはBeckman Coulter, Inc.の商標であり、USPTOに登録されています。

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