他の組織によって開発されたAMPure XPを用いたDNAサイズセレクションのプロトコルも存在しますが、弊社では性能の保証やこのアプリケーションのサポートはいたしません。DNAサイズセレクション専用に開発されたSPRIselectのご使用をお勧めします。AMPure XPとSPRIselectの違いについては、こちらのページをご覧ください。

SPRIselectとAMPure XPの主な違いは、使用目的です。SPRIselectは、ロットごとにDNAセレクションのための厳密なQCを行っているのに対し、AMPure XPはPCR精製やNGSクリーンアップのためのQCを行っています。詳しくはこちらのページをご覧ください。

AMPure XPはDNA/RNAの両方に結合することができますが、RNAClean XPがRNase free条件下で製造・QC確認されているのに対し、AMPure XP はRNase freeを担保していません。

AMPure XPは、ボトルに記載された保存温度で製造・試験されており、その温度でのみ性能を保証することができます。

いいえ。持ち込まれた磁性ビーズは、下流の酵素反応に悪影響を与えません。

可能ですが、溶出量が減ると収量が低下します。また、磁性ビーズが磁石に届かない場合には、磁性ビーズの持ち込みを避けるため、溶出液の一部をウェルに残す必要がある場合があります。磁性ビーズは、必ず溶出液に完全に懸濁してください。

磁性ビーズの核酸結合能は非常に高く、少なくとも核酸 7 μgをAMPure XP 1 μLに結合させることは可能です。しかし、この場合にはDNAにより粘度が高くなり、ピペッティングが困難になります。

収量は、フラグメントサイズ、サンプル量、サンプル濃度、溶出量、その他のいくつかの要因に依存します。理想的な条件下では回収率は90%に達しますが、最適でない条件下では60%にまで低下することもあります。

弊社の磁性ビーズは、結合、洗浄、溶出のための多因子平衡化学に従っています。結合バッファーは、磁性ビーズ表面上の結合部位（官能基）での核酸の結合を促進し、洗浄ステップはこの結合を保ちながら夾雑物を可溶化して除去します。溶出は磁性ビーズと核酸の結合状態を解き、精製核酸が溶液に遊離します。詳細はこちら。

最後のエタノール洗浄を除去した後、溶出バッファーを加える前に、乾燥工程を入れることができます。ゲノムDNAのような高分子量の場合には収量が低下するため、この乾燥工程の実施は推奨されません。40kbまでのDNA断片に関しては、乾燥工程を行うことができます。

ベックマン・コールター ライフサイエンスによる、AMPure XP 技術資料は こちら。