先進的で高度な研究にCytobankがお手伝いできること
Cytobank はサイトメトリーデータをはじめとした高次元ライフサイエンスデータを高度に解析するための
先進的なクラウドプラットフォームのソフトウエアです。
バイアスのないデータ探索も、とっかかりとなる解析も
|
|
||||
|
目標： パネルに含まれているマーカーで分けられるすべての細胞集団を見落としなく同定し解析対象に含めること |
目標： >多数のサンプルやタイムポイントのデータセットの特定の細胞集団の統計的な情報を得ること |
||||
|
例:
|
例:
|
||||
どのような研究課題に、どのマシンラーニングアルゴリズムが適しているか
- バイアスのないデータ探索
- CITRUS（シトラス）
多数のデータポイント情報から予測されるバイオマーカーを抽出します。クラスタリングと統計的群間比較を行い、 マニュアルゲーティング解析では得られない有意義な洞察を与えてくれます。
- FlowSOM（フローサム）
処理速度の速い Self-Organizing Map（SOM）アルゴリズムでのクラスタリングによって、すべての細胞での全 マーカープロファイルを明らかにすることでマニュアルゲーティング解析では見落とされてしまうような集団への気 付きを与えてくれます。
- とっかかりとなる解析
- FlowSOM（フローサム）
既存のSOM を用いて新たなサンプルのFlowSOM 解析を行うことができ、視覚的な比較も定量的な比較も可能 としてくれます。
Cytobankでのデータ解析の流れ：データを最大限に活用するためには
Cytobank を用いることで、ハイパラメータ（高次元）データの情報を理解しやすくまとめ、包括的な Figure を作成し、さらなる共同研究者間の円滑なディスカッションを可能とします。
Cytobank30日間フリートライアル
申し込みフォーム
以下のフォーム送信後、Cytobank sign up 用URLと日本語案内をEメールにてご案内いたしますので、日本語案内をお読みいただき、sign up（Cytobankアカウント登録）をお願いします。
ご登録後、ご登録されたメールアドレスに認証メールが届き、Cytobankが利用できるようになります。