核酸の抽出精製・各種前処理の自動化Method

当社では、お客様や各メーカーとパートナーシップを組み、最適なソリューションを開発・提供しています。当社のBiomek自動化NGSサンプル前処理Methodは、実際のサンプルを使用して高品質のデータを生成することが実証されており、Illumina ® 社 認定のNGS Methodも増えてきています。

各Biomek製品で実証済みMethodのあるキットについては下記をご参照ください。
赤字のキット名をクリックすると、アプリケーションノートがダウンロードされ、具体的なMethodをご確認いただけます。

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実証済みMethod
BIOMEK i7
ハイブリッドモデル
BIOMEK i7/i5
マルチチャンネルモデル
BIOMEK i5
SPAN8モデル
DNAおよびRNA
の精製・洗浄/
サイズ分画/
定量/正規化/
プールの作製
アジレント TapeStation 2200プレートの設定、DNA断片分析用
 
ベックマン AMPure XP - PCR産物の精製
 
 
ベックマン CleanSEQ - ダイターミネーターの除去
 
ベックマンSPRIselect - DNAサイズセレクション
 
 
コバリス DNA断片化プレートの設定、E220 Focused Ultrasonicator用
 
Promega Wizard MagneSil Tfx Plasmid Purification System
 
Quantitation/Normalization Protocols
 
Roche Kapa Biosystems Library
 
Quantification Kit - Illumina (96 and 384)
核酸の抽出
Apostle Minimax High Efficiency cfDNA Isolation kit - 血漿からのDNA抽出
 
 
ベックマン DNAdvance - 組織からのDNA抽出
 
 
ベックマン FormaPure XL DNA - FFPE組織からのDNA抽出
 
 
 
ベックマン FormaPure XL RNA - FFPE組織からのRNA抽出
 
 
ベックマンF ormaPure XL Total - FFPE組織からの全RNA抽出
 
 
ベックマン Formapure XL Total - 単一のFFPE組織サンプルからのDNAおよびRNAの抽出
 
 
ベックマン GenFind v3 - 血液、細胞、血清からのDNA抽出
 
 
 
ベックマン RNAdvance Blood - 血液からのRNA抽出
 
 
ベックマンRNAdvance Cell - 細胞からのRNA抽出
 
ベックマン RNAdvance Viral –ウイルスサンプルからのRNA抽出
 
ベックマン RNAdvance Tissue - 組織からのRNA抽出
 
 
Cytiva Sera-Xtracta HMW Kit
 
Cytiva Viral Pathogen RNA isolation Kit
 

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記号について:

 
実証済みMethod: ライブラリーキットメーカーのプロトコルに準じて開発された自動化用Methodで、科学的に妥当な標準的なサンプルを使用してメーカーの仕様を満たす結果が得られたMethod。実証はベックマン・コールターのラボ、またはユーザーのラボで実施。 *ベックマン・コールターがこれらのキットとそのMethodの性能に関して保証するものではありません。

Biomek 自動化ワークステーションおよびmethodは、病気やその他診断に使用することを意図したものでも、検証されたものでもありません。methodデータは生産前の自動化ワークステーションで作成されたものもございます。
特定された自動化methodはデモされたものであり、ベックマン・コールターによって検証されたものではありません。ベックマン・コールターは、このプロトコルに関して、特定目的への適合性、商品性、プロトコルが非侵害であることを含みますが、これに限らず明示または暗示のいかなる種類の保証も行ないません。すべての保証は、明示的に放棄されます。このmethodの使用は、あくまでも自己責任の上で行うものとします。病気やその他診断に使用することを意図したものでも、検証されたものでもありません。実証された方法は、ベックマン・コールターの自動化フィールドアプリケーションチームを通じて入手可能です。

 

自動化時の処理時間例

試薬キット アプリケーション 最大サンプル量 サンプル数 処理時間 *1
DNAdvance DNA抽出 動物細胞・組織 40 mg 96 / 192 0:56 / 1:33
GenFind V3 血液 400 µL 24 / 96 2:54 / 3:35
Apostle MiniMax cfDNA セルフリーDNA抽出 セルフリーDNA抽出血漿・
血清・尿 4 mL
48 4:45
RNAdvance Cell v2 RNA抽出 動物細胞 5万cells 24 / 96 2:37 / 3:00
RNAdvance Tissue 動物細胞・組織 10 mg 2:36 / 3:06
RNAdvance Blood 血液 400 μL 2:11 / 2:40
RNAdvance Viral ウイルス検出用スワブ・だ液
200 μL
96 / 192 1:07 / 1:15 *2
FormaPure XL DNA DNA抽出 10 μm FFPE組織切片 7枚 24 / 48 5:35 / 5:56 *3
FormaPure XL RNA RNA抽出 4:44 / 5:04 *3
FormaPure XL Total DNA / RNA別々に抽出 6:33 / 6:58 *3
AMPure XP DNA / PCR産物精製 96 / 384 0:19 / 0:43
RNAClean XP RNA / cDNA精製
SPRIselect DNAサイズセレクション 96 0:50 / 1:05 / 1:12 *4

*1 1 時間の表記は「時間: 分」です。
*2 サンプルlysis(ウイルス不活化)後の状態からの開始です。
*3 途中工程で、自動分注機外でのプレート遠心処理が必要です。
*4 合計処理時間は左から、レフトサイドセレクション、ライトサイドセレクション、ダブルサイズセレクションを示します。

 

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