合成生物学のためのEchoアコースティック分注機

 

合成生物ワークフローにおける複雑さの克服

Echo 525 Acoustic Liquid Handler

「Echoは非常に高速な装置です。時間の大幅な節約になります。われわれは約12時間のパイプラインを約3時間に圧縮することができました。」
-Dr. Sunil Chandran, Amyris Biotechnologies

Echoアコースティック分注機は、合成生物学のワークフローを大きく改善することが可能です。Echoテクノロジーにより、DNA合成の反応ボリュームを少量化し、処理を高速化し、さらに合成DNAの品質チェックのためのNGSライブラリー作製を低コストで効率的に実施することが出来きます。

Gibson Assembly (ギブソン・アセンブリ)、または、Golden Gate クローニング法のいずれの方法を使用する場合でも、Echo分注機で、チップを使用することなく、オリゴのプーリング、合成遺伝子の構築、コロニーのスポッティングを実施でき、さらに自動化システムAccess ワークステーションへ組み込むことにより、完全に自動化されたハイスループットシステムを構築することが出来ます。

Echoシステムにより、ワークフローをシンプルにし、時間とコストを節約できます。なぜなら:

  • プレートのウェルからウェルに自由に分注することが可能で、複雑な組み合わせアッセイが簡単
  • 最大100分の1の反応系で、劇的に試薬コストを減らし、貴重なサンプルの使用量も低減
  • 1秒以下での分注で、オリゴやDNAフラグメントのプーリングを迅速に実施
  • チップ不使用で、コンタミのリスクや吸着による損失なく、速く、精確に分注

Codex DNAでは、Echo 525分注機とAccessワークステーションが、BioXp™システムの遺伝子合成ワークフローの不可欠な部分になっています。従来の分注機では8時間かかるプロセスが、Echoでは30分未満で完了し、前例のない規模でDNAバリアントライブラリーを構築できるようになりました。さらに非接触のアコースティック分注の精確さにより、すべてのオリゴヌクレオチドを最大限の信頼性で提供できます。

John E. Gill, Senior Director of R&D, Codex DNA

最小25 nL~ の分注により、高濃度ライブラリーから希釈することなく、そのまま必要量を分注し、ノーマライゼーションと同時にプーリングが可能です。これにより、ライブラリーからプーリングまでのステップに係る時間が大幅に短縮し、単純化によりプロセスの信頼性が向上します。

さらに、Echoによる分注の精確さは、アッセイのノイズを低減し、より実験における検出感度を高めることにも貢献します。

合成生物マーケットをリードする企業や組織がEchoアコースティック分注機を使用し、いかに遺伝子合成を自動化し、複雑さを克服したかをご覧ください。

ノースウェスタン大学 Andrew Hunt博士によるWebセミナー
Accelerating Antibody Discovery with Cell Free Protein Synthesis and Automation

パスツール研究所 Olivier Borkowski博士によるWebセミナー
Active-learning Cell-free Protein Production Optimization

 

Echoアコースティック分注機で合成生物学を加速する

 

関連動画

 

Echoを用いるメリットについて
(Amyris Biotechnologies)

 

染色体合成における酵母コロニーの解析自動化プロセス
(NYU Langone Medical Center)

関連資料

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Journal of Laboratory Automation (JALA) Special Issue:
Paulina Kanigowska, Yue Shen, Yijing Zheng, Susan Rosser, and Yizhi Cai; School of Biological Sciences, University of Edinburgh

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合成生物ワークフローにおける
Echoアコースティック分注機の利点

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アコースティック分注による
合成生物学の合理化について

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