CD90（Thy-1）抗原は、Igスーパーファミリーで最も小さい（18kDa）分子です。糖鎖に富むグリコシル‐フォスファチジルイノシトール（GPI）結合型分子で、細胞外にIg-V様ドメインが一つあります。CD90抗原は広範な分布を示し、神経組織、結合組織、様々なストロマ細胞株に発現しています。多能性の造血前駆細胞活性を持つ胎児骨髄細胞中の希少なサブセットにCD90抗原が発現しています。この抗原は、ヒト骨髄、臍帯血、胎児肝のCD34陽性細胞のサブセットに発現しています。また、胸腺細胞のサブセットや末梢T細胞のごく少数のサブセットにも発現しています。