CD109抗原は、170kDaのグリコシル‐フォスファチジルイノシトール（GPI）結合型単鎖タンパク質です。エンドグリコシダーゼHに感受性のあるN結合型グリカンを複数含みますが、O結合型グリカンはありません。この分子はα2マクログロブリン（α2M）/ C3、C4、C5ファミリー・チオエステル含有タンパク質の新規分子として報告されています。CD109は、血管内皮細胞、一部の上皮細胞、活性化T細胞、活性化血小板、巨核球性白血病細胞、骨髄D34+細胞サブセットで認められています。この抗原分子は、新鮮末梢血リンパ球（PBL）には発現していません。未分化なT細胞性急性白血病細胞（CD34+、TdT+、CD7+）や、まれに慢性骨髄性白血病の巨核球性急性転化でCD109の発現が認められます。さらに、巨核芽球性の細胞株（MO7e, MOLM-1）もCD109＋です。CD109抗原は、KG1a細胞に20,000分子／細胞の強度で発現しており、巨核球系に分化傾向を示す造血細胞の非常に初期のマーカーである可能性があります。対照的に、成人骨髄のCD34+CD109+サブセットは、長期培養可能な最も発生初期の造血幹細胞とB細胞系統のリンパ前駆細胞とされています。