間葉系幹細胞（MSC）は、免疫抑制と組織リモデリングの強力な細胞メディエーターであると考えられています。他の細胞介入とは異なり、MSCは特定の状況下では同種異系移植を行うことができるため、免疫抑制細胞製品の開発のための有望な候補となっています。MSCはCD45、CD31、CD14、CD19の発現は陰性で、CD73、CD90は陽性です。CD34、CD105、CD146の発現は、由来する組織や、MSCがどの分化段階にあるかによって異なります。