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難病研究においてオルガノイド樹立は、特定の臓器病態解明や治療薬開発に不可欠ですが、その効率的かつ再現性の高いオルガノイド樹立には技術と経験が求められます。

オルガノイド樹立の工程は、まず、目的の細胞を含む組織を酵素処理により細胞分散します。次に目的の細胞をマーカーにより検出・分取し、分取した細胞を播種しオルガノイドの樹立を目指します。この工程で課題となるのは、組織を酵素処理で分散する工程が複雑で再現性が低いこと、そして、セルソーターでサンプルを測定するまでの時間の長さによる細胞へのストレス、分取をする際の手技などによる分取細胞への障害の可能性などがあります。これらに起因しオルガノイド樹立に問題が出る場合があります。

これらの課題に対し、プログラム制御により均一で再現性がある細胞分散が得られるCytiva社のVIA Extractor組織分散装置と、短時間で容易に細胞分取することが出来るBeckman Coulter社の卓上型セルソーターCytoFLEX SRTが有用です。特発性肺線維症（IPF）の難病モデルのオルガノイド樹立のアプローチを例として、質の高い前駆細胞を効率よく、かつ高純度で得るためのCytoFLEX SRTでの細胞分取におけるコツや考慮すべき点を中心に解説します。