Cytobank Premium

　クラウド型サイトメトリー解析ソフトウェア

Cytobankは、高次元なシングルセルデータのマシンラーニング解析を提供するクラウドベースのプラットフォームです。Premium Cytobankは共通クラウドでのライセンスで、研究室のPIや小規模な研究グループのニーズに合わせた設計になっています。お客様のニーズに合わせて、異なるタイプのライセンスをご用意しています。パワフルな次元圧縮やクラスタリング、予測のアルゴリズムでお客様の研究を加速させます。Cytobankプラットフォームをご利用いただくことで、フローサイトメトリーやマスサイトメトリー、その他のシングルセルデータを管理・保存できることに加え、あらゆるウェブ対応デバイスから、分野や物理的場所を超えて他の研究者と簡単に共同作業を行うことができます。


研究専用です。診断を目的とした使用はしないでください。

Resources + Tools
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Cytobank Premiumの特長

解析をより客観的に

  • FlowSOMまたはSPADEで、フェノタイプの類似した細胞を自動的にクラスタリング
  • viSNEで多次元のデータを2次元プロットとして視覚化することで、希少な細胞サブセットを容易に同定可能
  • CITRUSで、シングルセルデータを自動的に分類し、サンプルグループ間における統計学的な予測バイオマーカーを同定 

データから発見へ

コラボレーション

マシンラーニング解析を誰でも使えるように

  • コマンド入力プログラミングやプラグインが必要なく、バイオロジストでも使える設計で、操作方法はラーニングセンターで学習可能
  • オンラインのUSサポートサイト（英語）には、たくさんの記事、ヒントやコツのほか、日本語対応の質問リクエストフォームを用意
  • Experiment Managerを使用してプロジェクトの整理や検索を行ったり、ツリービューを使ってエクスペリメント間の関係を表示させたりすることが可能

製品モデル

Compatibility Loads any listmode file compliant with FCS standard up through version 3.1. DROP is able to import any numeric data in a text delimited (comma, semicolon, tab) format.
Plot Types Contour Plots, Density Plots, Dot Plots, Heatmap, Histograms, Overlay Plots
Gates CITRUS, FlowSOM, SPADE, viSNE, UMAP, opt-SNE, tSNE-CUDA
Statistics Channel Ranges, Coefficient of Variation (CV), Event Count, Event Count Ratio, Geometric Mean, Maximum, Mean, Median, Minimum, Percent in Gate (Literal), Percent of Population, Standard Deviation (SD), Variance
License Type Premium, Academic
Number of Users 5
License Term 1 Year

技術資料